بعض الخدمات التى يقوم بها المتحف
• الدراسة العلمية والبحوث المتطورة لجميع أنواع الحفريات الفقارية واللافقارية والمعادن والصخور والاحجار الكريمة ونشر هذه الدراسات بالتعاون مع العديد من الجامعات الاجنبية والمتاحف العالمية.
• مساعدة طلاب الدراسات العليا بالجامعات المصرية والاجنبية من خلال دراسات العينات وتقديم الخدمات العلمية وإتاحة الفرص للاطلاع بمكتبة المتحف.
• تبسيط علوم الجيولوجيا لطلاب المدارس فى مختلف المحافظات عند زيارتهم للمتحف عن طريق برامج خاصة تتضمن المحاضرات والشرح والتعليق على المعروضات بالمتحف.
• اهداء وبيع مجموعات تعليمية من عينات المعادن والصخور والحفريات الى المدارس والجامعات بناءً على طلبها وذلك لدعم العملية التعليمية ومعامل العلوم بالمدارس والجامعات وقصور الثقافة ونوادي العلوم على مستوى الجمهورية.
• تنظيم الدورات التدريبية لبعض الجهات مثل مدرسى وموجهى العلوم بوزارة التربية والتعليم ومفتشى الاثار ورجال الجمارك للتعرف على انواع الصخور والمعادن وخاصة الأحجار الكريمة.
• فحص العينات المصدرة للخارج بغرض اجراء الدراسات العلمية عليها للدارسين والباحثين بالجامعات والجهات المختلفة بمصر بحكم اختصاص الهيئة في هذا الشأن ومخاطبة الجمارك للسماح بتصديرها، كما يقوم المتحف بفحص الشحنات الواردة للجمهورية بالمنافذ الجمركية من الصخور والمعادن والحفريات بناء الى استدعاء من مصلحة الجمارك بحكم القانون 86 لسنة 56 وكذلك العينات الخاصة بشركات الذهب العاملة فى مصر المصدرة بغرض اجراء تحاليل لها
• تنظيم الدورات التدريبية المكثفة لبعض الجهات بالدول العربية الشقيقة في مجال الحفريات الفقارية واللافقارية
• الخبرة والخدمة التي يؤديها العاملون بالمتحف والتعليق على مقتنيات ومعروضات المتحف أثناء تسجيل البرامج العلمية التي ينتجها التليفزيون المصري بغرض نشر الوعي البيئي والجيولوجي بجميع وسائل الاعلام المقروءة والمسموعة والمرئية.